Q Exactive Plus vs Q Exactive HF 完整选型指南

一、核心硬件本质区别

1. 轨道阱核心（最关键差异）

• Q Exactive Plus：标准场 Orbitrap

  最高分辨率：140,000 @ m/z 200；选配 Biopharma 包最高 280,000Thermo Fis...

  最高扫描速度：12 Hz @17,500 分辨率，循环速度慢

• Q Exactive HF：超高场 D20 小型 Orbitrap（场强≈Plus 1.8 倍）

  原生最高分辨率：240,000 @ m/z 200，无需额外付费升级

  分辨率 15,000 下扫描速度18 Hz，同分辨率下循环速度比 Plus 快 30%~50%

2. 关键参数对比表

二、性能带来的实验差异

1. 蛋白组学（Bottom-up）

   HF 同梯度下多鉴定20% 蛋白、30% 独特肽段；可把 120 min 梯度压缩至 60 min，通量翻倍；DDA 能容纳更多母离子（Top20/Top25），复杂细胞 / 组织样本深度碾压 Plus。

2. DIA 非靶向定量

   HF 更快扫描速度大幅降低 DIA 窗口重叠、丢失碎片；复杂血浆 / 肿瘤样本定量重现性、覆盖度远优于 Plus。

3. 完整蛋白 Top-down / 单抗表征

   HF 超高分辨可基线分辨单抗轻重链同位素峰；Plus 仅能做简单完整蛋白，复杂修饰单抗解析吃力。

4. 小分子代谢 / 脂质 / 食品环境筛查

• Plus：常规农残、兽残、临床代谢、靶向 PRM 够用，性价比高；

• HF：复杂基质（粪便、土壤、血浆）未知物定性、脂质异构体区分、低丰度标志物筛查更有优势。

5. 靶向定量 PRM

   两者均可；但 HF 更快循环，可同时监测更多目标物，适合高通量多靶点临床样本。

   
   

6. 

三、分场景选型判断（直接对照）

✅ 选 Q Exactive Plus 的情况

1. 预算有限，以小分子为主

   食品、环境、毒理、常规临床代谢、药物杂质确证，日常筛查 + 定量，不需要超高通量。

2. 蛋白组仅做基础小样本

   少量细胞、简单微生物，每月样本量少，不追求深度覆盖、不做 TMT 多重标记。

3. 以常规 UHPLC（非纳流）为主

   1.0/2.1 mm 色谱柱，流速高、峰宽窄需求低，不需要超快扫描。

4. 对外共享平台、多领域混合使用

   兼顾小分子 + 少量蛋白，平衡成本与通用性，日常维护压力小。

5. 仅需中等分辨率定性

   无大量同分异构体、脂质、完整单抗表征需求。

✅ 选 Q Exactive HF 的情况

1. 深度蛋白质组学为核心方向

   细胞、组织、血浆、肿瘤样本；Label-free、TMT 标记、磷酸化 / 泛素化修饰组；大批量样本高通量分析。

2. Top-down 完整蛋白、抗体药表征

   单抗分子量、糖基化、轻重链修饰、完整蛋白同位素精细解析。

3. DIA 非靶向组学（代谢 / 脂质 / 蛋白）

   复杂生物样本，需要覆盖度、低丰度标志物挖掘。

4. 快速液相、超短梯度高通量流程

   纳流 LC、毛细管液相、30/60 min 快速梯度，追求单位时间样本产出。

5. 高难度复杂基质未知物鉴定

   内源性脂质异构体、微量污染物、共流出干扰严重样品，需要 240k 超高分辨区分质量差极小的峰。

6. 实验室样本量大、长期高通量产出

   课题组 / 平台常年大批量测序，需要缩短单针运行时间、提升年产出。

四、折中与补充建议

1. 仅做小分子、少量蛋白 → Plus，性价比；

2. 蛋白组 + 大分子生物药为主 → 必选 HF；

3. 经费卡在中间，既要小分子又要深度蛋白：

• 若以蛋白为主：咬牙上 HF；

• 若小分子检测占 70% 以上：Plus 搭配 Biopharma 高分辨选件，弥补大分子短板，但扫描速度仍不及原生 HF；

4. 升级路线：HF 后续可升级 HF-X 进一步提升灵敏度与扫描速度；Plus 无同档升级通道。

五、一句话总结

• 常规小分子检测、预算有限、低通量科研平台 → Q Exactive Plus

• 深度蛋白组、单抗表征、DIA、高通量纳流、复杂基质未知物定性 → Q Exactive HF